中华军的舰队开始向东转向，渐渐的脱离海岸线，好使得清军在岸上的士兵难以发现舰队的踪迹，大队离开海岸线十余海里之后开始开始向北转向，绕过南汇城之后抵达崇明岛。

崇明岛这个时候也在中华军的控制之下，岛上有七艘军舰和两百名守军，这个时候中华军的舰队抵达崇明岛之后补充了一些水和食物之后没做停留，因为崇明岛的港口太小，舰队的船只难以全部停靠，再加上目前的战局也不允许海军再做耽搁，因此大军继续前行，沿着长江出海口逆流而上，一路经过江阴、太洲、镇江之后抵达了南京城下。

这一路自然不是一帆风顺的，清军在长江的战略要道江阴修建了一处巨大的炮台，中华军如果想要进入江阴以西的水域，就势必要先将这里的炮台给拿下，不然的话在归途的时候很容易遭到清军的两面夹击。

江阴之战是中华军舰队在三天之内的第二场战斗，舰队以损失十三艘战舰的巨大代价拿下了江阴炮台，清军守军表现的出乎意料的顽强，完全是死战不退，立国之初的清军的战斗力确实不容小觑，但是正是因为他们的拼死抵抗，使得中华军大举进攻的消息立刻四下传播开来。

中华军被击沉了六艘战舰，七艘重伤，阵亡人数达到三百余人，这个伤亡数字可算是不小了，受伤的士兵也有两百多人，好在清军使用的都是实心弹，所以伤兵不太多，而阵亡的士兵也大多是落水之后来不及救援，被湍急的江水冲走溺死的。

在三艘战舰的护卫之下，这七艘战舰和两百多名伤兵顺流而下，返回了崇明岛，在此治疗休整，战舰则要等到工匠们慢慢修复，才能继续作战。

舰队离开江阴之后又在镇江再次和清军展开激战。镇江炮台的规模没有江阴那么大，士兵的战斗力也要差上很多，所以这一次中华军这边的损失十分轻微，只有三艘军舰被击伤。阵亡十六名士兵，以此代价就拿下了镇江炮台，也算是出乎了李权的预料了吧。

中华军一路大张旗鼓的行军，矛头直指江宁城（南京），这令南京城的清军大为紧张。清军一面闭守城门，一面从各地抽调兵力前来驻守，一时间扬州、凤阳、池州、庐州、宁国府的清军都被调动起来，八百里加急的快件也从南京星夜兼程送向北京。