1928年1月4日，蒋志清刚渡完蜜月便从上海抵达南京主持大计。

1 月9日，蒋志清正式通电就任国民革命军总司令一职，接着又担任了军事委员会主席、国民党中央政治会议主席等拥有实权的职务。下野之时，蒋志清任职仅限于国民革命军总司令。及至复出，则不仅官复原职，并更上层楼，出任国民党中央政治会议主席一职，并将政权亦一并掌握在手，集党、政、军大权于一身。

上位后的蒋志清痛定思痛，总结了此次下野的教训：没有预先掌握情报、制敌机先。

于是，蒋志清决定建立情报组织，充实情报人员，增加耳目，进一步加强特工活动。他建立的第一个特工组织是国民党中央组织部调查科。

1928 年2 月23 日，国民党中央常务委员会推蒋志清为组织部长，陈果夫为副部长。中央组织部下 设普通组织科、海外组织科、军人组织科、编审科、调查科、总务科等。其中调查科是第一次设立的机构，首任科主任由陈果夫之弟陈立夫担任。

在建立中央组织部调查科之外，蒋志清同时决定加强军事方面的情报工作。他在国民革命军总司令部里，一下子任命了数十名侍从副官和联络参谋。

这些人几乎清一色出身于黄埔军校，其任务就是搜集各部队的情况和各级部队长的政治倾向、思想动态、主要活动等，其工作都直接向蒋志清个人负责，并由原任黄埔军校教育长的王柏龄主持其事。这些专职情报特务中，除了蔡劲军、胡靖安 等老牌特务外，又增加了不少新人，其中便有戴笠。戴笠在蒋志清下野期间积极搜集情报，颇有成效，加之胡靖安力荐，蒋志清破格提升戴笠为国民革命军总司令部上尉联络参谋。

蒋志清复任国民革命军总司令以后，提出要重新整顿和建设国民革命军的口号。 目的是要把军权牢牢掌握在自己手里，驾驭派系林立的新军阀。当务之急，蒋认为是要整顿好自己的嫡系部队第一军。第一军重整完毕，即提出“二次北代”的口号，消灭以张作霖为代表的奉系集团。1928 年3 月31 日，蒋志清将第一集团军改编为四个军团，分别部署在向北进攻的位置上。

4 月7 日。国民党中央发表北伐宣言，4 月10 日。一、二、三集团军同时下达攻击令，总攻开始。