秀保介入不过四天，叛乱便被压制，这一幕让包括五大老和五奉行在内的众大名惊叹不已，德川家康没想到秀保竟会绕过五大老直接出兵，且速度之快让人咋舌，心知宇喜多诠家已经在劫难逃，便暗中命埋伏在他身边的奸细趁夜将其缢杀，以免将他们之间的秘密公诸天下。四月十一日，随着宇喜多秀家与明石久藏达成和解，富山城开城投降，这场为期十六天的叛乱终以秀家的胜利告终，此役反长船派共有四十余名千石以上家臣遭到斩杀，近五十名家臣选择出仕他家或者成为浪人，这些人的总知行达到十四万石，占所有家臣总知行的四成。此后由于秀保和五大老的居中调和，有一部分的反长船派返回宇喜多家，但由于中村刑部的失势以及长船氏的断绝，长船派彻底销声匿迹，他们转而支持一向保持中立的明石全登，使得明石成为家宰，反长船派势单力薄，且领头人物皆已伏法，无奈之下，放弃了对执政权的争夺，暂时和中立派妥协，直到六月二十日花房职则被流放常陆，宇喜多骚动才算是告一段落。

这场持续三个月之久、牵扯到各家利益的骚乱，最终使得宇喜多秀家自废武功，丧失了四到五成的动员力，转眼间沦为徒有虚名的二流大名；而石田三成和德川家康，作为争端两派的幕后黑手，都对这一结果大为失望，不过相较于希望拉拢宇喜多家的石田三成，德川家康倒是乐观宇喜多家的衰败：“本家不需要一个强大的宇喜多，就这一点来说已经算是达到了，至于他是不是本家的傀儡，现在看来似乎没那么重要了，倒是右府在处理骚乱中的表现，让老夫很是担忧。”

“这是太阁殡天后发生的第二次大规模战事，上次大阪的叛乱已让他出尽风头，这次他居然以后见的名义号令四国和淡路的大名出兵，足以见得他的地位已经逐渐稳固，好在宇喜多家的破败使他丧失了一个重要的盟友，不过这并不是本家掉以轻心的理由，相反，正是由于他在近畿已经无人能敌，才使得联合上杉家的计划迫在眉睫，正信，此番你和正纯一同去会津，一定要将上杉家拉拢过来，否则…夺取天下就无从谈起了！”

“臣下一定不辱使命！”本多正信重重地点了点头，即日便启程前往会津若松城，由于四面皆是亲秀保的大名，为防万一，本多父子只好先经西北仙石秀久的小诸城，之后乔装在真田领内走过一段山路，进入堀秀治的越后，稍做休息，由津川口进入会津地界，最终于七月八日抵达上杉家的居城若松城。

不过很不凑巧，由于是秘密前往，抵达的当天上杉景胜和直江兼续都不在城中，而是前往位于阿賀川畔的神指原，那里正在兴建一座新的城池以替代若松城，而新城池的普请奉行便是直江兼续的弟弟大国实赖，足以见得直江山城守在上杉家的地位和影响力。

之所以另建新城，据说是由于若松城位于会津盆地东南边缘，人口稠密很难扩建，而神指原位于盆地中央，且旁边有阿賀川提供水源，交通便利，更利于领内的管理。可这在本多正信看来，不过是上杉景胜掩人耳目的一个噱头罢了。

其实在来会津前夕，本多正信便得到一个消息，由于直江兼续对最上义光的禁令视若罔闻，仍暗地里修建朝日军道，导致两家关系进一步恶化，所带来的结果便是最上义光派兵破坏已经修了近一半的军道，强行遣散修路民工，并将带头的几名上杉家臣逮捕，而直江兼续不甘示弱，屯兵两方边界，大战似有一触即发之势。不过当时全日本的焦点都集中在宇喜多骚动上，因此，这一冲突除了五大老和五奉行之外，也就只有东北的几个大名知晓。五月八日，就在两军对峙近半个月之后，德川家康近水楼台先得月，率先令德川秀忠从江户派人前往会津调解，碍于德川家的威信，最上义光不得不表示妥协，允许上杉家继续修建朝日军道，但军道沿途的路卡必须由最上家控制，且上杉家每年必须缴纳一定量的费用和米粮。

对于这一要求，上杉景胜甚为恼火，觉得若是向最上家缴纳费用并接受其监督，那还不如走其他官道，何须自己另辟蹊径？于是，上杉景胜拒绝了最上义光的要求，试图强行铺设军道，而德川家康此时则召回使者，任由两家矛盾升级。

很明显，这是德川家的一招毒计，蓄意挑拨两家关系，之后再派本多父子劝诱，考虑到最上义光是秀保的岳父，上杉景胜定会站在自己这边，而且，从上杉家最近的动作可以看出，他们已经对战争有了准备，现在就差最后一根稻草，便能让这条越后之龙再次兴风作浪。